Cumhuriyet Başsavcılığınca kamu davası olarak Mustafa Atsız hakkında 'Görevi Kötüye Kullanma ve Kurum Araçlarını Şahsi İşlerine Kullanma' suçlarından dava açılmıştı. Mahkeme heyeti, yapılan yargılama sonucu, Mustafa Atsız'ın zimmet suçunu işlediğinin sabit görüldüğü için 5 yıl, suçu zincirleme olarak işlediği için 6 yıl 3 ay, duruşma öncesi tüm zararları giderdiği için cezada indirim yaparak 3 yıl 1 ay 15 gün, zimmete konu değer cezanın yüksek olmaması nedeniyle 1 yıl 3 ay 18 gün hapis cezası verdi. Mahkeme, hükmün geri açıklanmasına karar vermişti. Atsız, duruşmada 'Beyt-ül mal'a (devlet hazinesi) el uzatıldıysa o el kırılmalıdır" demişti.
Kayseri İl Özel İdaresi Genel Sekreterliği görevinde iken görevinden alınan şuan Nevşehir Vali Yardımcısı olan Mustafa Atsız hakkında 'Görevi Kötüye Kullanma ve Kurum Araçlarını Şahsi İşlerine Kullanma' suçundan açılan davada Atsız’a 1 yıl 3 ay 18 gün hapis cezası veren 2. Ağır Ceza Mahkeme Başkanı Levent Şahin, normal hakim olarak Afyonkarahisar’a atandı.
HSYK’nın atamalarının ardından Vali yardımcısı Mustafa Atsız, sosyal paylaşım sitesinden konu ile ilgili şu görüşleri paylaştı: “Başarılı çalışmaları ile ünlü hakim ve savcılarımızdan bazıları çok çalıştıkları için biraz istirahate alınmışlar. Malum kumpas kolay iş değil.”
Öte yandan, hakim Levent Şahin 19 Haziran 2011 Adli Yargı Yaz Kararnamesi ile Sinop Ağır Ceza Mahkeme Başkanlığı’ndan, Kayseri Ağır Ceza Mahkeme Başkanlığı’na atanmış, yaklaşık 4 yıldır Kayseri’de görev yapıyordu.
