Memduh Boydak Melikşah Üniversitesi Mütevelli Heyet başkanıyken 16 Eylül 2015 tarihinde paralel yapı operasyonu kapsamında gözaltına almış ve adli kontrol şartıyla serbest bırakılmıştı. 21 Aralık 2015 tarihinde de Cumhurbaşkanına hakaretten Boydak hakkında soruşturma başlatılmıştı. Kayseri’de Paralel yapıya yönelik operasyonlar devam ederken birçok kişi tutuklandı ve gözaltına alındı. Son olarak İş Adamı Hamdi Kınaş FETÖ’YE finansman sağlamak suçundan tutuklandı. KAYSO başkanı Mustafa Boydak odanın meclis toplantısında hükümetin paralel yapı ile mücadelesini eleştirerek isim vermeden Kayserili bazı işadamlarının üzerinde oyunlar oynandığını söylemişti. Mustafa Boydak, FETÖ üyeliği ve bu örgüte yardım ve yataklıktan tutuklanan Hamdi KINAŞ ve diğer tutuklanan işadamlarını savunarak, bu tutuklamalar ile sanayiciler üzerine hükümet tarafından bir takım oyunlar oynandığını da iddia etmişti. Mustafa Boydak’ın ardından Memduh Boydak da sosyal medya üzerinden, ““Son zamanlarda en büyük Üzüntülerim, Şehitlerimiz, Güneydoğu'da yaşanan dramlar, Mültecilerin durumu, Masum insanlara suçlar isnat edilmesi” açıklamasını yapınca, ‘masum insanlara suçlar isnat edilmesi’ sözleriyle akıllara “Memduh Boydak da mı tutuklanan iş adamlarına sahip çıkıyor?” sorusunu getirdi.
